ФГУП «ВНИИ «Центр» создан в 1966 году приказом Министра судостроительной промышленности в соответствии с Постановлением ЦК КПСС и СМ СССР «Об улучшении работы по созданию и внедрению в народное хозяйство средств вычислительной техники и автоматизированных систем управления», как Главный вычислительный Центр Министерства судостроительной промышленности (ГВЦ МСП).
Становление ГВЦ Минсудпрома СССР проходило в период подъема отечественного судостроения, что потребовало от коллектива слаженной работы по формированию графиков строительства важнейших заказов, планов поставок комплектующего оборудования и материалов, обеспечению контроля за продвижением технической готовности строящихся кораблей и судов.
В целях обеспечения решения этих задач ГВЦ разработал и в 1982 году ввел в эксплуатацию отраслевую автоматизированную систему управления ОАСУ «Темп», в составе которой были сформированы кустовые информационные центры, автономные информационные пункты на предприятиях.
Распоряжением Совета Министров СССР от 27 апреля 1982 г. № 826-рс ГВЦ Минсудпрома был преобразован в Центральный научно-исследовательский институт систем автоматизации управления и применения вычислительной техники (ЦНИИ «Центр») с тремя филиалами в городе Николаеве, Комсомольске - на - Амуре и в Северодвинске. Одновременно, приказом Минсудпрома СССР от 31.05.1982 г. № 252 на Институт было возложено выполнение функций головного предприятия отрасли по системам автоматизации управления и применению вычислительной техники и утвержден «Координационный план по созданию ОИАСУ».
С образованием ЦНИИ «Центр» в судостроительной отрасли начался новый этап широкого внедрения вычислительной техники. К середине 80-х годов в отрасли было создано 129 автоматизированных систем управления промышленными объединениями и предприятиями, более 60 АСУ НИИ и КБ, 43 узла связи. Активно работали филиалы Института, разрабатывая и внедряя задачи по технологической подготовке производства, анализу производственно-хозяйственной деятельности предприятий, управления отдельными видами производств судостроительных заводов.
В 1986 г. Институтом была разработана и утверждена Министерством «Отраслевая программа развития систем автоматизации различного назначения и применения вычислительной техники в XII пятилетие и на период до 2000 года», которая определила дальнейшие направления деятельности Института – разработка и внедрение новых информационных технологий на основе широкого внедрения персональных ЭВМ и локальных вычислительных сетей. Предприятиям отрасли было поставлено около 1000 ПЭВМ, а для руководства и аппарата Министерства было разработано и введено в опытную эксплуатацию более 30 автоматизированных рабочих мест.
После распада СССР и упразднения Минсудпрома СССР деятельность Института осуществлялась под управлением Департамента судостроительной промышленности Министерства промышленности Российской Федерации.
Для обеспечения информационно-аналитической поддержки деятельности Департамента в этот переходный период в 1992 году был сформирован Отраслевой информационно-аналитический центр (ОИАЦ), основными задачами которого являлись анализ технико-экономических показателей производственно-хозяйственной деятельности и конверсии предприятий отрасли, прогнозирование социально-экономического развития и программ совершенствования деятельности отрасли.
Создание ОИАЦ позволило сохранить для отрасли опытных специалистов расформированного Минсудпрома СССР и положить начало новому направлению - аналитическим и прогнозным исследованиям в ЦНИИ «Центр».
С образованием в 1999 году Федерального агентства по судостроению (Россудостроение) задачи ЦНИИ «Центр» по информационно-аналитической поддержке отраслевого органа управления существенно расширились. ЦНИИ «Центр» активно участвовал в подготовке заседаний научно-технического совета, Коллегии Россудостроения, готовил материалы по вопросам формирования интегрированных структур в отрасли, проводил мониторинг хода интеграции в отрасли.
В 2004 году в ходе административной реформы агентства по оборонным отраслям промышленности были объединены в Федеральное агентство по промышленности (Роспром), в котором ЦНИИ «Центр», получивший в 2001 году статус ФГУПа, был назначен головной организацией по информационно-аналитическому обеспечению деятельности Федерального агентства по промышленности, а также по развитию и совершенствованию функционирования Единой информационной системы Роспрома (приказ № 550 от 28.10.2005 г.).
Работы ФГУП «ЦНИИ «Центр» во исполнение указанного приказа выполнялись в тесном взаимодействии с головными институтами отраслей Роспрома, которые и составляли «ядро» Единой информационной системы.
В 2009 году приказом Министерства промышленности и торговли Российской Федерации Институт назначен уполномоченной организацией по сбору и обработке первичных статистических и административных данных организаций и промышленного и оборонно-промышленного комплексов Министерства промышленности и торговли Российской Федерации.
В соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 10 февраля 2018 г. № 62 «О федеральном государственном унитарном предприятии «Всероссийский научно-исследовательский институт «Центр», распоряжением Правительства Российской Федерации от 16 апреля 2018 г. № 679-р, распоряжением Росимущества от 9 июня 2018 г. № 406-р федеральное государственное унитарное предприятие «Центральный научно-исследовательский институт судостроительной промышленности «Центр» реорганизовано в форме присоединения к нему федерального государственного унитарного предприятия «Научно-исследовательский институт стандартизации и унификации» (ФГУП «НИИСУ») с последующим переименованием во ФГУП «Всероссийский научно-исследовательский институт «Центр» (ФГУП «ВНИИ «Центр»).
По существу, ФГУП «ВНИИ «Центр», начиная с 2005 года, выполняет функции головной организации по информационно-аналитическому обеспечению деятельности органов управления ОПК.
Многопрофильная научная организация ФГУП «ВНИИ «Центр» проводит исследования в интересах Минпромторга России, Минобороны России, Федеральной службы охраны Российской Федерации, Морской коллегии при Правительстве Российской Федерации, Военно-промышленной комиссии Российской Федерации, государственных корпораций «Ростехнологии» и «Роснано».
Участвуя в выполнении Федеральных целевых программ «Развитие оборонно-промышленного комплекса», «Развитие гражданской морской техники», «Мировой океан», институт создал и поддерживает уникальные базы данных показателей деятельности организаций оборонно-промышленного комплекса, с использованием которых осуществляется информационно-аналитическая поддержка деятельности отраслевых департаментов Минпромторга России.
В Институте разрабатываются долгосрочные прогнозы развития науки и техники в интересах обороны страны и безопасности государства, краткосрочные прогнозы социально-экономического развития отраслей ОПК. Разработана и функционирует методика проведения еженедельного мониторинга по принятию мер финансового оздоровления организаций ОПК с использованием портала сбора данных.
В Институте созданы и функционируют:
- информационно-аналитический центр ОПК;
- федеральный кадровый центр мониторинга подготовки квалифицированных кадров для организаций ОПК Российской Федерации;
- центр научного и информационно-аналитического сопровождения деятельности Морской коллегии при Правительстве Российской Федерации;
- центр статистических наблюдений и аналитических исследований промышленности;
- центр программно-целевого планирования и структурных преобразований промышленности;
- межотраслевой центр обеспечения ценообразования в сфере ГОЗ
и другие.